Struktur organisasi LPPM Universitas Madura terdiri dari pimpinan, bidang penelitian, bidang pengabdian masyarakat, serta unit administrasi penelitian.
Pimpinan
- Kepala LPPM
- Sekretaris LPPM
Bidang
- Bidang Penelitian dan Publikasi Ilmiah
- Bidang Pengabdian kepada Masyarakat dan KKN
- Bidang Administrasi dan Kerjasama
Susunan organisasi dapat diperbarui melalui panel admin sesuai SK terbaru.